Jon M. Chu ne sera pas le réalisateur de GI Joe 3. Le cinéaste lâche la franchise, selon les déclarations de Dwayne Johnson à Collider. Il devrait réaliser l'adaptation au cinéma du dessin animé Jem et les Hologrammes. "Ouais. Le but est de tourner le prochain GI Joe en janvier de l'année prochaine. C'est l'idée (...) Pour le moment on cherche encore un réalisateur", confie l'acteur.
C'est Evan Daugherty, le scénariste de Blanche-Neige et le Chasseur, qui sera chargé d'écrire le script de GI Joe 3. On croyait les deux scénaristes de GI Joe 2, Paul Wernick et Rhett Reese, affairés à rédiger le scénario mais la Paramount a changé son fusil d'épaule il y a quelques mois.